Delta-Stepping 单源最短路径
词汇表
- 有向
-
有向特性。该算法在有向图上定义良好。
- 有向
-
有向特性。该算法忽略图的方向。
- 有向
-
有向特性。该算法不能在有向图上运行。
- 无向
-
无向特性。该算法在无向图上定义良好。
- 无向
-
无向特性。该算法忽略图的无向性。
- 异构节点
-
异构节点完全支持。该算法能够区分不同类型的节点。
- 异构节点
-
异构节点允许。该算法对所有选定节点一视同仁,无论其标签如何。
- 异构关系
-
异构关系完全支持。该算法能够区分不同类型的关系。
- 异构关系
-
异构关系允许。该算法对所有选定关系一视同仁,无论其类型如何。
- 加权关系
-
加权特性。该算法支持将关系属性用作权重,通过relationshipWeightProperty配置参数指定。
- 加权关系
-
加权特性。该算法将每个关系视为同等重要,并丢弃任何关系权重的数值。
简介
Delta-Stepping 最短路径算法计算图中源节点和所有可达节点之间的所有最短路径。该算法支持具有正关系权重的加权图。要计算源节点和单个目标节点之间的最短路径,可使用Dijkstra 源-目标算法。
与Dijkstra 单源算法不同,Delta-Stepping 算法是一种距离校正算法。此特性使其能够并行遍历图。该算法保证总能找到源节点和目标节点之间的最短路径。然而,如果两个节点之间存在多条最短路径,则不能保证该算法在每次计算中都返回相同的路径。
GDS 实现基于 [1] 并结合了 [2] 中讨论的桶融合优化。算法实现使用多个线程执行,这些线程可在过程配置中定义。
有关此算法的更多信息,请参见
语法
本节介绍在每种执行模式下执行 Delta-Stepping 算法所使用的语法。我们将介绍命名图语法的变体。要了解有关一般语法变体的更多信息,请参见语法概述。
CALL gds.allShortestPaths.delta.stream(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
index: Integer,
sourceNode: Integer,
targetNode: Integer,
totalCost: Float,
nodeIds: List of Integer,
costs: List of Float,
path: Path
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
configuration |
映射 |
|
是 |
用于算法特定设置和/或图过滤的配置。 |
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定节点标签过滤命名图。将包含具有任何给定标签的节点。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定关系类型过滤命名图。将包含具有任何给定类型的关系。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可提供的 ID,以便更轻松地跟踪算法进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,则不会记录进度百分比。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性的名称。如果未指定,算法将无权重运行。 |
|
名称 | 类型 | 描述 |
---|---|---|
index |
整数 |
找到路径的基于 0 的索引。 |
sourceNode |
整数 |
路径的源节点。 |
targetNode |
整数 |
路径的目标节点。 |
totalCost |
浮点数 |
从源到目标的总成本。 |
nodeIds |
整数列表 |
路径上节点的 ID,按遍历顺序。 |
costs |
浮点数列表 |
路径上每个节点的累计成本。 |
path |
路径 |
表示为 Cypher 实体的路径。 |
变异模式在投影图中创建新关系。每个关系代表从源节点到目标节点的路径。路径的总成本通过totalCost
关系属性存储。
CALL gds.allShortestPaths.delta.mutate(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
mutateMillis: Integer,
configuration: Map
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
configuration |
映射 |
|
是 |
用于算法特定设置和/或图过滤的配置。 |
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
mutateRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于写入投影图的新关系的类型。 |
字符串列表 |
|
是 |
使用给定节点标签过滤命名图。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定关系类型过滤命名图。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可提供的 ID,以便更轻松地跟踪算法进度。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性的名称。如果未指定,算法将无权重运行。 |
名称 | 类型 | 描述 |
---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
图预处理的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
mutateMillis |
整数 |
将关系添加到投影图的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
添加的关系数量。 |
configuration |
映射 |
用于运行算法的配置。 |
写入模式在 Neo4j 数据库中创建新关系。每个关系代表从源节点到目标节点的路径。额外的路径信息使用关系属性存储。默认情况下,写入模式存储totalCost
属性。或者,也可以存储路径上中间节点的nodeIds
和costs
。
CALL gds.allShortestPaths.delta.write(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
writeMillis: Integer,
configuration: Map
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
configuration |
映射 |
|
是 |
用于算法特定设置和/或图过滤的配置。 |
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定节点标签过滤命名图。将包含具有任何给定标签的节点。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定关系类型过滤命名图。将包含具有任何给定类型的关系。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可提供的 ID,以便更轻松地跟踪算法进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,则不会记录进度百分比。 |
|
整数 |
|
是 |
用于将结果写入 Neo4j 的并发线程数。 |
|
writeRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于在 Neo4j 数据库中持久化计算出的关系的类型。 |
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性的名称。如果未指定,算法将无权重运行。 |
|
writeNodeIds |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 nodeIds 列表属性。 |
writeCosts |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 costs 列表属性。 |
名称 | 类型 | 描述 |
---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
图预处理的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
writeMillis |
整数 |
将关系写入 Neo4j 的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
写入的关系数量。 |
configuration |
映射 |
用于运行算法的配置。 |
CALL gds.allShortestPaths.delta.stats(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
configuration: Map
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
configuration |
映射 |
|
是 |
用于算法特定设置和/或图过滤的配置。 |
名称 | 类型 | 默认值 | 可选 | 描述 |
---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定节点标签过滤命名图。将包含具有任何给定标签的节点。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定关系类型过滤命名图。将包含具有任何给定类型的关系。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可提供的 ID,以便更轻松地跟踪算法进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,则不会记录进度百分比。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性的名称。如果未指定,算法将无权重运行。 |
|
名称 | 类型 | 描述 |
---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
图预处理的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
configuration |
映射 |
用于运行算法的配置。 |
示例
以下所有示例都应在空数据库中运行。 示例使用Cypher 投影作为规范。本机投影将在未来的版本中弃用。 |
本节将展示在具体图上运行 Delta-Stepping 算法的示例。目的是说明结果的外观,并提供在实际设置中如何使用该算法的指南。我们将在一个由少量节点以特定模式连接的小型交通网络图上进行此操作。示例图如下所示
CREATE (a:Location {name: 'A'}),
(b:Location {name: 'B'}),
(c:Location {name: 'C'}),
(d:Location {name: 'D'}),
(e:Location {name: 'E'}),
(f:Location {name: 'F'}),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(b),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(c),
(a)-[:ROAD {cost: 100}]->(d),
(b)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 80}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 30}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 80}]->(f),
(e)-[:ROAD {cost: 40}]->(f);
该图构建了一个连接不同位置的交通网络。就像在现实世界中一样,图中的道路具有不同的长度。这些长度由cost
关系属性表示。
MATCH (source:Location)-[r:ROAD]->(target:Location)
RETURN gds.graph.project(
'myGraph',
source,
target,
{ relationshipProperties: r { .cost } }
)
在以下示例中,我们将演示如何使用此图运行 Delta-Stepping 最短路径算法。
内存估算
首先,我们将使用estimate
过程估算运行算法的成本。这可以通过任何执行模式完成。在本例中,我们将使用write
模式。估算算法有助于了解在图上运行算法将产生的内存影响。当您以后实际在某个执行模式下运行算法时,系统将执行一次估算。如果估算显示执行极有可能超出其内存限制,则将禁止执行。要了解更多信息,请参见自动估算和执行阻止。
有关estimate
的更多详细信息,请参见内存估算。
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.write.estimate('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
RETURN nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
节点计数 | 关系计数 | 最小字节数 | 最大字节数 | 所需内存 |
---|---|---|---|---|
6 |
9 |
368 |
576 |
"[368 字节 ... 576 字节]" |
流
在stream
执行模式下,算法返回每个源-目标对的最短路径。这使我们能够直接检查结果或在 Cypher 中对其进行后处理,而不会产生任何副作用。
有关stream
模式的更多详细信息,请参见流。
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.stream('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
delta: 3.0
})
YIELD index, sourceNode, targetNode, totalCost, nodeIds, costs, path
RETURN
index,
gds.util.asNode(sourceNode).name AS sourceNodeName,
gds.util.asNode(targetNode).name AS targetNodeName,
totalCost,
[nodeId IN nodeIds | gds.util.asNode(nodeId).name] AS nodeNames,
costs,
nodes(path) as path
ORDER BY index
index | 源节点名称 | 目标节点名称 | totalCost | 节点名称 | costs | path |
---|---|---|---|---|---|---|
0 |
"A" |
"A" |
0.0 |
["A"] |
[0.0] |
[Node[0]] |
1 |
"A" |
"B" |
50.0 |
["A", "B"] |
[0.0, 50.0] |
[Node[0], Node[1]] |
2 |
"A" |
"C" |
50.0 |
["A", "C"] |
[0.0, 50.0] |
[Node[0], Node[2]] |
3 |
"A" |
"D" |
90.0 |
["A", "B", "D"] |
[0.0, 50.0, 90.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3]] |
4 |
"A" |
"E" |
120.0 |
["A", "B", "D", "E"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4]] |
5 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "B", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4], Node[5]] |
结果显示了节点A
与图中所有其他可达节点之间最短路径的总成本。它还显示了按顺序排列的遍历以查找最短路径的节点 ID 列表,以及访问节点的累计成本。这可以在示例图中验证。Cypher Path 对象可以通过path
返回字段返回。Path 对象包含节点对象和具有cost
属性的虚拟关系。
变异
mutate
执行模式用新关系更新命名图。每个新关系代表从源节点到目标节点的路径。关系类型通过mutateRelationshipType
选项配置。路径的总成本使用totalCost
属性存储。
mutate
模式在多个算法协同使用时特别有用。
有关mutate
模式的更多详细信息,请参见变异。
mutate
模式运行算法MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.mutate('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
mutateRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
relationshipsWritten |
---|
6 |
执行上述查询后,内存中的图将更新为类型为PATH
的新关系。新关系将存储单个属性totalCost
。
生成的关系始终是有向的,即使输入图是无向的。 |
写入
write
执行模式用新关系更新 Neo4j 数据库。每个新关系代表从源节点到目标节点的路径。关系类型通过writeRelationshipType
选项配置。路径的总成本使用totalCost
属性存储。中间节点 ID 使用nodeIds
属性存储。到达中间节点的累计成本使用costs
属性存储。
有关write
模式的更多详细信息,请参见写入。
write
模式运行算法MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.write('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH',
writeNodeIds: true,
writeCosts: true
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
relationshipsWritten |
---|
6 |
上述查询将把 6 个类型为PATH
的关系写回 Neo4j。这些关系存储三个描述路径的属性:totalCost
、nodeIds
和 costs
。
写入的关系始终是有向的,即使输入图是无向的。 |