拆分关系

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引言

拆分关系算法是一种实用算法,用于对图进行预处理,以便进行模型训练。它将关系拆分为一个保留集和一个剩余集。保留集分为两类:正样本,即现有关系,以及负样本,即不存在的关系。关系的label属性指示其类别。这使得保留集可以用于训练或测试机器学习模型。保留集和剩余关系都会添加到投影图中。

如果指定了配置选项relationshipWeightProperty,则相应的关系属性将保留在剩余的关系集中。但请注意,保留集只有label属性;由于保留集也包含负样本,因此无法在保留集上引入关系权重。

语法

本节介绍在每种执行模式下运行拆分关系算法所使用的语法。我们正在描述命名图语法的变体。要了解更多关于通用语法变体的信息,请参阅语法概览

按模式划分的拆分关系语法
在命名图上以修改模式运行拆分关系算法。
CALL gds.alpha.ml.splitRelationships.mutate(
  graphName: String,
  configuration: Map
)
YIELD
  preProcessingMillis: Integer,
  computeMillis: Integer,
  mutateMillis: Integer,
  relationshipsWritten: Integer,
  configuration: Map
表 1. 参数
名称 类型 默认值 可选 描述

graphName

字符串

不适用

存储在目录中的图名称。

configuration

映射

{}

算法特定配置和/或图过滤配置。

表 2. 配置
名称 类型 默认值 可选 描述

sourceNodeLabels

字符串列表

['*']

过滤源节点具有至少一个 sourceNodeLabels 中标签的关系。

targetNodeLabels

字符串列表

['*']

过滤目标节点具有至少一个 targetNodeLabels 中标签的关系。

relationshipTypes

字符串列表

['*']

使用给定关系类型过滤命名图。

concurrency

整数

4 [1]

运行算法时使用的并发线程数。

jobId

字符串

内部生成

一个 ID,可以提供以便更轻松地跟踪算法进度。

logProgress

布尔值

true

如果禁用,将不会记录进度百分比。

holdoutFraction

浮点数

不适用

用作保留集的有效关系的比例。剩余的 1 - holdoutFraction 比例的有效关系将添加到剩余集中。

negativeSamplingRatio

浮点数

不适用

保留集中负样本与正样本的期望比例。

holdoutRelationshipType

字符串

不适用

用于保留集的关系类型。每个关系都有一个label属性,指示它是正样本还是负样本。

remainingRelationshipType

字符串

不适用

如果某个节点不包含源或目标标签中的任何一个,则该关系将被省略。所有无效关系都将添加到剩余集中。

nonNegativeRelationshipTypes

字符串列表

不适用

不用于负采样的额外关系类型。

relationshipWeightProperty

字符串

null

remainingRelationshipType继承的关系属性名称。

randomSeed

整数

不适用

用于关系随机选择的可选种子值。

1. 在 GDS 会话中,默认值为可用处理器数量

表 3. 结果
名称 类型 描述

preProcessingMillis

整数

数据预处理的毫秒数。

computeMillis

整数

运行算法的毫秒数。

mutateMillis

整数

向投影图添加属性的毫秒数。

relationshipsWritten

整数

算法创建的关系数量。

configuration

映射

用于运行算法的配置。

示例

以下所有示例均应在空数据库中运行。

示例通常使用Cypher 投影。原生投影将在未来的版本中弃用。

在本节中,我们将展示在具体图上运行拆分关系算法的示例。目的是说明结果如何以及提供如何在实际环境中利用该算法的指南。我们将在一个由少量节点以特定模式连接而成的小图上进行此操作。示例图如下所示

Visualization of the example graph

考虑通过以下 Cypher 语句创建的图

CREATE
    (n0:Label),
    (n1:Label),
    (n2:Label),
    (n3:Label),
    (n4:Label),
    (n5:Label),

    (n0)-[:TYPE { prop: 0} ]->(n1),
    (n1)-[:TYPE { prop: 1} ]->(n2),
    (n2)-[:TYPE { prop: 4} ]->(n3),
    (n3)-[:TYPE { prop: 9} ]->(n4),
    (n4)-[:TYPE { prop: 16} ]->(n5)

给定上述图,我们希望使用 20% 的关系作为保留集。保留集将分为两个大小相同的类别:正样本和负样本。正样本关系将从现有关系中随机选择并标记属性label: 1。负样本关系将随机生成,即它们在输入图中不存在,并标记属性label: 0

MATCH (source:Label)-[r:TYPE]->(target:Label)
RETURN gds.graph.project(
  'graph',
  source,
  target,
  {
    sourceNodeLabels: ['Label'],
    targetNodeLabels: ['Label'],
    relationshipType: 'TYPE'
  },
  { undirectedRelationshipTypes: ['TYPE'] }
)

现在我们可以通过指定适当的比例和输出关系类型来运行算法。我们使用随机种子值以产生确定性结果。

CALL gds.alpha.ml.splitRelationships.mutate('graph', {
    holdoutRelationshipType: 'TYPE_HOLDOUT',
    remainingRelationshipType: 'TYPE_REMAINING',
    holdoutFraction: 0.2,
    negativeSamplingRatio: 1.0,
    randomSeed: 1337
}) YIELD relationshipsWritten
表 4. 结果
relationshipsWritten

10

输入图包含 5 个关系。我们使用 20%(1 个关系)的关系来创建“TYPE_HOLDOUT”关系类型(保留集)。这会创建 1 个带有正标签的关系。由于negativeSamplingRatio,还会创建 1 个带有负标签的关系。最后,使用剩余的 80%(4 个关系)形成TYPE_REMAINING关系类型。这些关系以方向UNDIRECTED写入,这相当于写入 8 个关系。

当按TESTTRAIN关系过滤时,修改后的图将如下所示。
CREATE
    (n0:Label),
    (n1:Label),
    (n2:Label),
    (n3:Label),
    (n4:Label),
    (n5:Label),

    (n2)-[:TYPE_HOLDOUT { label: 0 } ]->(n5), // negative, non-existing
    (n3)-[:TYPE_HOLDOUT { label: 1 } ]->(n2), // positive, existing

    (n0)<-[:TYPE_REMAINING { prop: 0} ]-(n1),
    (n1)<-[:TYPE_REMAINING { prop: 1} ]-(n2),
    (n3)<-[:TYPE_REMAINING { prop: 9} ]-(n4),
    (n4)<-[:TYPE_REMAINING { prop: 16} ]-(n5),
    (n0)-[:TYPE_REMAINING { prop: 0} ]->(n1),
    (n1)-[:TYPE_REMAINING { prop: 1} ]->(n2),
    (n3)-[:TYPE_REMAINING { prop: 9} ]->(n4),
    (n4)-[:TYPE_REMAINING { prop: 16} ]->(n5)
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