Dijkstra 单源最短路径

词汇表

有向

有向特性。该算法在有向图上定义良好。

有向

有向特性。该算法忽略图的方向。

有向

有向特性。该算法不在有向图上运行。

无向

无向特性。该算法在无向图上定义良好。

无向

无向特性。该算法忽略图的无向性。

异构节点

异构节点 完全支持。该算法能够区分不同类型的节点。

异构节点

异构节点 允许。该算法以相同的方式处理所有选定的节点,而不管其标签。

异构关系

异构关系 完全支持。该算法能够区分不同类型的关系。

异构关系

异构关系 允许。该算法以相同的方式处理所有选定的关系,而不管其类型。

加权关系

加权特性。该算法支持使用关系属性作为权重,通过 relationshipWeightProperty 配置参数指定。

加权关系

加权特性。该算法将每个关系视为同等重要,忽略任何关系权重的值。

介绍

Dijkstra 最短路径算法计算节点之间的最短路径。该算法支持具有正关系权重的加权图。Dijkstra 单源算法计算从源节点到所有可到达节点的最短路径。要计算源节点和目标节点之间的最短路径,可以使用 Dijkstra 源-目标

GDS 实现基于原始描述,并使用二叉堆作为优先队列。该实现也用于A*Yen's 算法,以及加权介数中心性。算法实现使用单个线程执行。您可以考虑Delta-Stepping 作为一种有效的并行最短路径算法。

语法

本节介绍在每种执行模式下执行 Dijkstra 算法时使用的语法。我们正在描述命名的图语法变体。要了解有关一般语法变体的更多信息,请参阅语法概述

每种模式的 Dijkstra 语法
在命名图上以流模式运行 Dijkstra。
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.stream(
  graphName: String,
  configuration: Map
)
YIELD
  index: Integer,
  sourceNode: Integer,
  targetNode: Integer,
  totalCost: Float,
  nodeIds: List of Integer,
  costs: List of Float,
  path: Path
表 1. 参数
名称 类型 默认值 可选 描述

graphName

字符串

n/a

存储在目录中的图的名称。

configuration

映射

{}

算法特定配置和/或图过滤。

表 2. 配置
名称 类型 默认值 可选 描述

nodeLabels

字符串列表

['*']

使用给定的节点标签过滤命名图。将包含具有任何给定标签的节点。

relationshipTypes

字符串列表

['*']

使用给定的关系类型过滤命名图。将包含具有任何给定类型的关系。

concurrency

整数

1

该算法是单线程的,更改并发参数不会影响运行时间。

jobId

字符串

在内部生成

可提供的 ID,以便更容易跟踪算法的进度。

logProgress

布尔值

如果禁用,则不会记录进度百分比。

sourceNode

整数

n/a

Neo4j 源节点或节点 ID。

relationshipWeightProperty

字符串

用作权重的关系属性的名称。如果未指定,则算法将不带权重运行。

表 3. 结果
名称 类型 描述

index

整数

找到的路径的 0 索引。

sourceNode

整数

路径的源节点。

targetNode

整数

路径的目标节点。

totalCost

浮点数

从源到目标的总成本。

nodeIds

整数列表

路径上节点 ID 的遍历顺序。

costs

浮点数列表

路径上每个节点的累积成本。

path

路径

以 Cypher 实体表示的路径。

mutate 模式在投影图中创建新的关系。每个关系都代表从源节点到目标节点的路径。路径的总成本通过 totalCost 关系属性存储。

在命名图上以 mutate 模式运行 Dijkstra。
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.mutate(
  graphName: String,
  configuration: Map
)
YIELD
  relationshipsWritten: Integer,
  preProcessingMillis: Integer,
  computeMillis: Integer,
  postProcessingMillis: Integer,
  mutateMillis: Integer,
  configuration: Map
表 4. 参数
名称 类型 默认值 可选 描述

graphName

字符串

n/a

存储在目录中的图的名称。

configuration

映射

{}

算法特定配置和/或图过滤。

表 5. 配置
名称 类型 默认值 可选 描述

mutateRelationshipType

字符串

n/a

用于写入投影图的新关系的关系类型。

nodeLabels

字符串列表

['*']

使用给定的节点标签过滤命名图。

relationshipTypes

字符串列表

['*']

使用给定的关系类型过滤命名图。

concurrency

整数

4

用于运行算法的并发线程数。

jobId

字符串

在内部生成

可提供的 ID,以便更容易跟踪算法的进度。

sourceNode

整数

n/a

Neo4j 源节点或节点 ID。

relationshipWeightProperty

字符串

用作权重的关系属性的名称。如果未指定,则算法将不带权重运行。

表 6. 结果
名称 类型 描述

preProcessingMillis

整数

预处理图的毫秒数。

computeMillis

整数

运行算法的毫秒数。

postProcessingMillis

整数

未使用。

mutateMillis

整数

将关系添加到投影图的毫秒数。

relationshipsWritten

整数

添加的关系数。

configuration

映射

用于运行算法的配置。

write 模式在 Neo4j 数据库中创建新的关系。每个关系都代表从源节点到目标节点的路径。使用关系属性存储其他路径信息。默认情况下,write 模式存储 totalCost 属性。可以选择存储路径上中间节点的 nodeIdscosts

在命名图上以 write 模式运行 Dijkstra。
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.write(
  graphName: String,
  configuration: Map
)
YIELD
  relationshipsWritten: Integer,
  preProcessingMillis: Integer,
  computeMillis: Integer,
  postProcessingMillis: Integer,
  writeMillis: Integer,
  configuration: Map
表 7. 参数
名称 类型 默认值 可选 描述

graphName

字符串

n/a

存储在目录中的图的名称。

configuration

映射

{}

算法特定配置和/或图过滤。

表 8. 配置
名称 类型 默认值 可选 描述

nodeLabels

字符串列表

['*']

使用给定的节点标签过滤命名图。将包含具有任何给定标签的节点。

relationshipTypes

字符串列表

['*']

使用给定的关系类型过滤命名图。将包含具有任何给定类型的关系。

concurrency

整数

1

该算法是单线程的,更改并发参数不会影响运行时间。

jobId

字符串

在内部生成

可提供的 ID,以便更容易跟踪算法的进度。

logProgress

布尔值

如果禁用,则不会记录进度百分比。

writeConcurrency

整数

'concurrency' 的值

用于将结果写入 Neo4j 的并发线程数。

writeRelationshipType

字符串

n/a

用于将计算出的关系持久化到 Neo4j 数据库中的关系类型。

sourceNode

整数

n/a

Neo4j 源节点或节点 ID。

relationshipWeightProperty

字符串

用作权重的关系属性的名称。如果未指定,则算法将不带权重运行。

writeNodeIds

布尔值

如果为真,则写入的关系具有 nodeIds 列表属性。

writeCosts

布尔值

如果为真,则写入的关系具有 costs 列表属性。

表 9. 结果
名称 类型 描述

preProcessingMillis

整数

预处理图的毫秒数。

computeMillis

整数

运行算法的毫秒数。

postProcessingMillis

整数

未使用。

writeMillis

整数

将关系写入 Neo4j 的毫秒数。

relationshipsWritten

整数

写入的关系数。

configuration

映射

用于运行算法的配置。

示例

以下所有示例都应在空数据库中运行。

这些示例使用Cypher 投影 作为规范。原生投影将在未来版本中弃用。

在本节中,我们将展示在具体图上运行 Dijkstra 算法的示例。目的是说明结果的样子,并提供在实际环境中使用算法的指南。我们将在一个只有几个节点以特定模式连接的小型交通网络图上执行此操作。示例图如下所示

Visualization of the example graph
以下 Cypher 语句将在 Neo4j 数据库中创建示例图
CREATE (a:Location {name: 'A'}),
       (b:Location {name: 'B'}),
       (c:Location {name: 'C'}),
       (d:Location {name: 'D'}),
       (e:Location {name: 'E'}),
       (f:Location {name: 'F'}),
       (a)-[:ROAD {cost: 50}]->(b),
       (a)-[:ROAD {cost: 50}]->(c),
       (a)-[:ROAD {cost: 100}]->(d),
       (b)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
       (c)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
       (c)-[:ROAD {cost: 80}]->(e),
       (d)-[:ROAD {cost: 30}]->(e),
       (d)-[:ROAD {cost: 80}]->(f),
       (e)-[:ROAD {cost: 40}]->(f);

该图构建了一个交通网络,其中包含位置之间的道路。就像在现实世界中一样,图中的道路具有不同的长度。这些长度由 cost 关系属性表示。

以下语句将使用 Cypher 投影投影图,并将其存储在图目录中,名称为 'myGraph'。
MATCH (source:Location)-[r:ROAD]->(target:Location)
RETURN gds.graph.project(
  'myGraph',
  source,
  target,
  { relationshipProperties: r { .cost } }
)

在以下示例中,我们将演示使用此图的 Dijkstra 最短路径算法。

内存估计

首先,我们将使用 estimate 过程来估计运行算法的成本。这可以通过任何执行模式来完成。在本例中,我们将使用 write 模式。估计算法对于了解在图上运行算法所带来的内存影响很有用。当您稍后在其中一种执行模式下实际运行算法时,系统将执行估计。如果估计表明执行很可能超过其内存限制,则将禁止执行。要详细了解这一点,请参阅自动估计和执行阻塞

有关 estimate 的更多详细信息,请参阅内存估计

以下将估计以 write 模式运行算法所需的内存
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.write.estimate('myGraph', {
    sourceNode: source,
    relationshipWeightProperty: 'cost',
    writeRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
RETURN nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
表 10. 结果
nodeCount relationshipCount bytesMin bytesMax requiredMemory

6

9

736

736

"736 字节"

stream 执行模式下,算法返回每对源-目标的的最短路径。这使我们能够直接检查结果或在 Cypher 中对其进行后处理,而不会产生任何副作用。

有关 stream 模式的更多详细信息,请参阅

以下将运行算法并流式传输结果
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.stream('myGraph', {
    sourceNode: source,
    relationshipWeightProperty: 'cost'
})
YIELD index, sourceNode, targetNode, totalCost, nodeIds, costs, path
RETURN
    index,
    gds.util.asNode(sourceNode).name AS sourceNodeName,
    gds.util.asNode(targetNode).name AS targetNodeName,
    totalCost,
    [nodeId IN nodeIds | gds.util.asNode(nodeId).name] AS nodeNames,
    costs,
    nodes(path) as path
ORDER BY index
表 11. 结果
index sourceNodeName targetNodeName totalCost nodeNames costs path

0

"A"

"A"

0.0

["A"]

[0.0]

[节点[0]]

1

"A"

"B"

50.0

["A", "B"]

[0.0, 50.0]

[节点[0], 节点[1]]

2

"A"

"C"

50.0

["A", "C"]

[0.0, 50.0]

[节点[0], 节点[2]]

3

"A"

"D"

90.0

["A", "B", "D"]

[0.0, 50.0, 90.0]

[节点[0], 节点[1], 节点[3]]

4

"A"

"E"

120.0

["A", "B", "D", "E"]

[0.0, 50.0, 90.0, 120.0]

[节点[0], 节点[1], 节点[3], 节点[4]]

5

"A"

"F"

160.0

["A", "B", "D", "E", "F"]

[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0]

[节点[0], 节点[1], 节点[3], 节点[4], 节点[5]]

结果显示了节点 A 与图中所有其他可达节点之间的最短路径的总成本。它还显示了遍历以找到最短路径的节点 ID 的有序列表,以及访问节点的累积成本。这可以在示例图 中进行验证。Cypher 路径对象可以通过 path 返回字段返回。路径对象包含节点对象和具有 cost 属性的虚拟关系。

mutate

mutate 执行模式使用新的关系更新命名图。每个新关系都代表从源节点到目标节点的路径。关系类型使用 mutateRelationshipType 选项配置。总路径成本使用 totalCost 属性存储。

当多个算法结合使用时,mutate 模式特别有用。

有关 mutate 模式的更多详细信息,请参阅mutate

以下将以 mutate 模式运行算法
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.mutate('myGraph', {
    sourceNode: source,
    relationshipWeightProperty: 'cost',
    mutateRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
表 12. 结果
relationshipsWritten

6

执行上述查询后,内存中图将使用类型为 PATH 的新关系进行更新。新的关系将存储单个属性 totalCost

生成的关系列表始终是有向的,即使输入图是无向的也是如此。

写入

write 执行模式使用新的关系更新 Neo4j 数据库。每个新关系都代表从源节点到目标节点的路径。关系类型使用 writeRelationshipType 选项配置。总路径成本使用 totalCost 属性存储。中间节点 ID 使用 nodeIds 属性存储。到达中间节点的累积成本使用 costs 属性存储。

有关 write 模式的更多详细信息,请参阅写入

以下将以 write 模式运行算法
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.dijkstra.write('myGraph', {
    sourceNode: source,
    relationshipWeightProperty: 'cost',
    writeRelationshipType: 'PATH',
    writeNodeIds: true,
    writeCosts: true
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
表 13. 结果
relationshipsWritten

6

上述查询将 6 个类型为 PATH 的关系写回 Neo4j。这些关系存储了描述路径的三个属性:totalCostnodeIdscosts

写入的关系始终是有向的,即使输入图是无向的也是如此。